换一批
换一批分子动力学模拟探讨Annexin A5的N-末端对其结构的影响
The Effect of N-terminus of Annexin A5 on its Structure by Molecular Dynamics Simulations
摘要研究ANX A5的N-末端存在与否对其核心区域结构以及四级结构的影响.ANX家族蛋白的显著特征是含有高度保守的C-端核心序列以及多变的N-末端结构,核心序列由4个重复的同源序列构成,具有明显的同源性,而N-末端的序列及长度在进化过程中表现出很大的多样性.为了研究N-末端对ANX蛋白的意义,文章以ANX A5为例,采用分子动力学模拟的手段分别对ANX A5单体和三聚体进行了模拟,研究N-末端对ANX A5的核心区域结构以及四级结构的影响.模拟结果显示,N-末端存在与否并不影响ANX A5单体/亚基的结构,对钙离子的结合也没有大的影响;但是N-末端存在与否对ANX A5核心序列四级结构造成了很大的影响,三聚体有加速分散的趋势,从而猜测N-末端对ANX A5的亚基之间聚合有重要作用.综上可得,N-末端存在与否不会对其核心区域的结构稳定以及与Ca2+的结合造成大的影响,但是对于ANX A5三聚体结构的形成是必不可少的.
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关键词
膜联蛋白A5N-末端蛋白核心序列三聚体的形成四级结构分子动力学Annexin A5N-terminusAnnexin coreFormation of trimerQuaternary structureMolecular dynamics simulations
分类号
Q7
栏目名称
DOI
10.19526/j.cnki.1005-8915.20170401
发布时间
2017-10-27
基金项目
国家自然科学基金资助项目（81630092,81573338）
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