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hsa-miR-146a-5p的靶基因预测及生物信息学分析

Target Gene Prediction and Bioinformatic Analysis of hsa-miR-146a-5p

摘要目的:采用生物信息学方法探究hsa-miR-146a-5p在不同疾病中的表达差异,对hsa-miR-146a-5p的靶基因的生物学功能进行预测分析.方法:利用miRBase等数据库分析miR-146a-5p在不同物种间的保守性.应用TargetScan、miRDB、mirDIP和miRTarBase靶基因数据库预测靶基因,最终确定 hsa-miR-146a-5p 的靶基因集合范围,然后通过String数据库进行PPI分析,从而构建所预测靶基因集合编码蛋白质间的相互关系网络图.最后通过DAVID数据库对靶基因进行GO功能注释和KEGG信号通路富集分析.结果:miR-146a-5p的成熟碱基序列在各物种间高度保守;筛选出150 个hsa-miR-146a-5p的靶基因,TLR4、TRAF6、IL6、NFKB1、EGFR为关键靶基因.通过GO分析及KEGG分析,发现这些靶基因显著富集于Toll样受体信号通路、乙型肝炎、肿瘤通路、恰加斯病、NF-κB等信号通路中.结论:本研究为深入探索hsa-miR-146a-5p的分子调控机制及检测潜在的生物标志物提供理论依据.

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DOI 10.19381/j.issn.1001-7585.2023.17.001
发布时间 2023-09-18(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
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