基于数据库构建乳腺癌耐药相关ceRNA网络及预后生物标志物筛选
Construction of Drug-Resistance Association in Breast Cancer Based on Database ceRNA Network and Prognostic Bi-omarker Screening
摘要目的:基于数据库构建乳腺癌耐药相关ceRNA网络,筛选预后生物标志物.方法:在GEO数据库中下载乳腺癌耐药相关的circRNA、miRNA、mRNA转录组芯片数据.使用R包筛选出具有差异表达的circRNA、miRNA、mRNA.从TCGA数据库中下载乳腺癌患者的临床数据,与差异表达的mRNA数据整合并进行单因素Cox分析、Lasso回归分析、多因素COX回归分析,创建出关乳腺癌耐药相关的预后风险模型.结果:利用多种数据库构建网络中差异最显著的12个circRNA、9个miRNA、15个mRNA组成ceRNA,构建出关于乳腺癌耐药的预后风险模型.最后得到乳腺癌耐药的ceRNA预后子网络,其中3个mRNA有望作为乳腺癌耐药相关的新型预后标志物.结论:本研究组建起了一个乳腺癌耐药相关的circRNA-miRNA-mRNA调控ceRNA网络体系.GNG4、NDRG1、CHAC1有望成为乳腺癌耐药的预测相关预后的一种新型生物标志物.
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