换一批粗茎秦艽转录组及其环烯醚萜类生物合成相关基因分析与验证
Transcriptome analysis and exploration of genes involved in the biosynthesis of iridoids in Gentiana crassicaulis(Gentianaceae)
摘要龙胆科龙胆属Gentiana秦艽组(Sect.Cruciata)粗茎秦艽Gentiana crassicaulis Duthie ex Burk.为中药秦艽及藏药"解吉那保"()基原植物之一,含有龙胆苦苷等环烯醚萜类活性成分,具有重要的药用价值.本文对粗茎秦艽转录组进行测序分析,分别构建其根、茎、叶、花转录组数据库,并对可能参与编码环烯醚萜苷类合成通路中关键酶的部分unigene进行qRT-PCR验证.结果如下:①共得到159 534条unigene,平均长度为679.根据GO功能分类,可将unigene分为3大类67分支;基于KOG功能可将unigene分为25类;②KEGG代谢通路分析发现粗茎秦艽中215条unigene参与到20个次生代谢标准通路中,有305条unigene参与编码环烯醚萜苷类合成通路中的28个关键酶,且在不同部位中的表达存在差异;③qRT-PCR与RNA-Seq结果基本吻合,实验涉及的HMGS、DXS、MCS、GPPS、G10H、7-DLNGT及STR 7个基因皆为地上部位(茎、叶、花)的相对表达量高于地下部位(根).环烯醚萜类为中药秦艽、龙胆、当药及青叶胆等药材的指标性成分及活性成分之一,本工作可为应用生物技术方法获取环烯醚萜类活性成分或其中间体,探讨药用植物次生产物累积规律、不同生态型品种的质量评价及药材道地性形成机制研究等提供基础科学资料.
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