换一批胰岛素分泌细胞诱导过程中miRNA-mRNA调控网络的生物信息学分析
Bioinformatic Analyses of miRNA-mRNA Regulatory Network During Differentiation of Insulin-producing Cells
摘要目的 探讨人胚胎干细胞(hESCs)向胰岛素分泌细胞(IPCs)诱导分化过程中基因表达的差异,并构建miRNA-mRNA调控网络.方法 选择GEO数据库内的GSE42094数据集作为研究对象,应用GEO2R分析差异表达基因,对其进行GO功能和KEGG路径以及蛋白互作网络分析,选用miRTarBase数据库预测其靶miRNA,对miRNA-mRNA调控网络进行可视化,并采用文献数据验证.结果 共得到差异表达基因188个,选取诱导后显著下调基因共21个,分析发现POU5F1、DNMT3B和NANOG 3个基因集中在"基因表达调控",且下调基因在"胞核内"比较集中;通过查找靶miRNA,发现miR-335-5p能够调控POU5F1、DNMT3B、NANOG、FAM124B和LECT1 5个基因的表达;验证发现有24个miRNA能够被文献数据验证.结论 基于显著下调基因构建的miRNA-mRNA调控网络参与干细胞诱导分化进程并发挥重要作用.
更多相关知识
栏目名称
DOI
10.3969/j.issn.1006-1959.2023.18.002
发布时间
2023-11-22（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
基金项目
辽宁省教育厅科学研究经费面上项目（LJKZ1374）
- 浏览0
- 被引1
- 下载0
相似文献
- 中文期刊
- 外文期刊
- 学位论文
- 会议论文
