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基于公共数据库分析FOXM1在软组织肉瘤中的表达及临床预后意义

Expression and Prognostic Significance of FOXM1 Gene in Soft Tissue Sarcomas Based on the Public Database

摘要目的 分析叉头转录因子M1(FOXM1)在软组织肉瘤(STSs)中的表达及临床预后价值.方法 通过Oncomine数据库分析FOXM1在常见恶性肿瘤尤其是STSs中的表达水平,随后在TCGA数据库中进行验证;在CCLE数据库分析FOXM1在STSs细胞系中的表达水平,在UALCAN数据库中分析STSs中FOXM1表达与性别、种族及年龄分组的差异;通过GEPIA数据库分析FOXM1与STSs患者预后的关系,及其与PI3K/AKT信号通路关键分子在STSs中的表达相关性;在STRING数据库分析FOXM1互作蛋白的相互作用网络.应用在线数据库DAVID对FOXM1及互作基因进行GO功能注释和KEGG信号通路富集分析.结果 Oncomine数据库中共9项涉及STSs组织和对应癌旁组织中FOXM1表达的研究,并且FOXM1在STSs中均呈高表达(P<0.05),TCGA数据库的验证结果与Oncomine数据库挖掘结果一致.FOXM1在STSs细胞中呈普遍高表达(P<0.05),且FOXM1的表达水平与性别相关,与种族、年龄无关.GEPIA数据库分析显示,FOXM1低表达患者的总生存期(OS)和无疾病生存期(DFS)均高于高表达者(P<0.05);在STSs组织中FOXM1的表达水平与磷脂酰肌醇3-激酶催化亚基α(PIK3CA)、AKT1及哺乳动物雷帕霉素靶蛋白(mTOR)的表达水平均呈正相关(r=0.26、0.43、R=0.42).蛋白相互作用网络分析发现,CCNB1、PLK1、CDK1、CCNA2、MYBL2、CCNB2、CENPF、CDK2、CDC25A、CDC20 等蛋白与 FOXM1 具有明显相互作用.GO富集分析显示,这些基因涉及的生物学功能包括细胞分裂与细胞周期调控等.KEGG富集分析显示,这些基因主要参与的信号通路包括p53信号通路、FOXO信号通路及P13K-Akt信号通路等.结论 FOXM1在软组织肉瘤中呈高表达,且与软组织肉瘤患者的预后相关,其机制可能与调控PI3K/AKT信号通路有关.

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作者 马靖琳 [1] 王婷 [2] 肖红斌 [2] 王翠芳 [3] 安丽萍 [3] 周延峰 [3] 学术成果认领
作者单位 兰州大学第二医院/甘肃省骨关节疾病研究重点实验室,甘肃 兰州 730030;兰州理工大学石油化工学院,甘肃 兰州 730050 [1] 兰州大学第二临床医学院,甘肃 兰州 730030 [2] 兰州大学第二医院/甘肃省骨关节疾病研究重点实验室,甘肃 兰州 730030 [3]
分类号 R738.6
栏目名称 生物信息学
DOI 10.3969/j.issn.1006-1959.2024.01.001
发布时间 2024-01-19
基金项目
甘肃省自然科学基金 甘肃省教育厅高等学校创新基金项目 兰州大学第二医院萃英科技创新计划 兰州大学第二临床医学院萃英学子科研培育计划 兰州大学第二临床医学院萃英学子科研培育计划
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