换一批
换一批miR-144/451基因簇调控网络的生物信息学分析
Bioinformatic analysis of the miR-144/451 cluster mediated regulation network
摘要目的 生物信息学方法 是预测miRNA二级结构及miRNA靶基因的有用工具.miRNA、转录因子和靶基因之间的调控网络参与多种生理、病理活动的分子机制.文中用生物信息学方法 预测mir-144/451基因簇的调控网络结构.方法 运用多个在线数据库,研究miR-144/451基因簇的上游转录因子及下游靶基因间的多个反馈和前反馈环路,对参与miR-144/451基因簇调控环路的基因进行功能聚类分析,绘制miR-144/451基因簇的核心调控网络图.结果 miR-144/451基因簇与其上游转录因子GATA1有17个共调控的靶基因,与生物体蛋白磷酸化、性腺发育、上皮细胞分化、葡萄糖代谢等生化学过程密切相关,并参与胰岛素信号通路、哺乳动物雷帕霉素靶蛋白(mammalian target of rapamycin,mTOR)信号通路、血管内皮生长因子(vascular endothelial growth factor,VEGF)信号通路、自然杀伤细胞介导的细胞毒作用、Toll样受体信号通路、ErbB信号通路及黄体酮调节卵细胞成熟等体内重要生理过程.结论 对miR-144/451基因簇调控网络的生物信息学分析有助于理解其在细胞发育、细胞周期调控和肿瘤发生过程中的作用机制,为后续实验提供了理论依据.
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分类号
Q522
栏目名称
基础研究
DOI
10.3969/j.issn.1008-8199.2012.03.002
发布时间
2012-05-07
基金项目
国家自然科学基金
江苏省自然科学基金
高等学校博士学科点专项科研基金
高校基本科研业务费专项资金
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