换一批摘要目的 采用生物信息学方法探究心脏衰老的关键基因.方法 从基因表达综合数据库(Gene Expression Omnibus,GEO)中选择基因表达谱 GSE8146.通过 R软件进行相关分析,筛选出年轻小鼠与老年小鼠心脏中差异表达基因,利用 DAVID 6.8 在线分析工具对差异表达基因进行基因本体(Gene Ontology,GO)功能富集分析和京都基因与基因组百科全书(Kyoto Ency-clopedia of Genes and Genomes,KEGG)信号通路富集分析.基于 STRING 在线数据库进行蛋白互作(protein-protein interaction,PPI)网络分析获得关键基因.结果 共筛选出 55 个差异表达基因,其中上调基因 22 个,下调基因 33 个.差异表达基因显著富集于脂质代谢、脂肪酸代谢等过程,参与了过氧化物酶体增殖物激活受体(peroxisome proliferators-activated receptor,PPAR)、腺苷酸活化蛋白激酶(adenosine5'-monophosphate-activated protein kinase,AMPK)信号通路等通路功能.筛选出 Fasn、Pck1、Adipoq、Cpt1a、Pdk4、Pnpla2、Slc27a1、Hmgcs2、Cidec、Ucp3 等关键基因.结论 心脏衰老可能与细胞能量代谢障碍相关,Fasn、Pck1、Adipoq、Cpt1a、Pdk4、Pnpla2、Slc27a1、Hmgcs2、Ucp3 等关键基因及PPAR、AMPK信号通路等可能在心脏衰老的发生、发展中发挥重要作用.
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关键词
心脏衰老生物信息学差异表达基因基因本体京都基因与基因组百科全书Cardiac agingBioinformaticsDifferentially expressed genesGene OntologyKyoto Encyclopedia of Genes and Genomes
栏目名称
DOI
10.11969/j.issn.1673-548X.2023.11.010
发布时间
2023-12-27（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
基金项目
国家自然科学基金（81871359）
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