换一批孟德尔随机化联合Meta分析miRNA在溃疡性结肠炎中的关系及潜在机制
Relationship and Potential Mechanisms between MiRNA and Ulcerative Colitis from Meta-analysis of Mendelian Randomization
摘要目的 通过孟德尔随机化(Mendelian randomization,MR)联合Meta分析(MR-Meta分析)并结合生物信息学分析挖掘,旨在鉴定microRNA(miRNA)与溃疡性结肠炎(ulcerative colitis,UC)之间的因果关系,并分析其潜在的生物学功能和通路,以寻找新的生物学标志物和潜在的治疗靶点.方法 利用miRNA暴露数据和多个UC结局数据集,通过MR-Meta分析鉴定miRNA与UC间的因果关系.随后利用基因表达数据库提取UC的微阵列数据进行差异分析,对MR-Meta-miRNA进行差异表达检测,并将检测的候选miRNA差异靶基因进行机器学习算法筛选出关键基因.然后通过免疫细胞浸润、单基因富集分析(gene set enrichment analysis,GSEA)关键基因的功能和通路,并构建ceRNA调控网络.结果 通过MR-Meta分析鉴定出9个miRNA与UC风险显著相关.通过GES48959芯片数据分析显示hsa-miR-196b-5p在UC组织中显著低表达,随后将hsa-miR-196b-5p靶向的差异基因通过2种机器学习算法得到了关键基因MAP3K1.经GSEA和免疫浸润分析显示,MAP3K1是调节免疫炎症的关键基因.ceRNA调控网络表明,lncRNA/hsa-miR-196b-5p/MAP3K1具有调节UC病变的潜力.结论 miRNA与UC存在因果关系,其中hsa-miR-196b-5p与UC风险密切相关,hsa-miR-196b-5p/MAP3K1通路可能作为调控UC免疫炎症的分子机制影响疾病的发生和进展,并为今后探索UC的有效诊断和治疗提供了新的思路.
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关键词
溃疡性结肠炎孟德尔随机化microRNAMeta分析MAP3K1Ulcerative colitisMendelian randomizationMicroRNAMeta-analysisMAP3K1
分类号
R516（传染病）
栏目名称
DOI
10.11969/j.issn.1673-548X.2025.02.015
发布时间
2025-03-24（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
基金项目
国家自然科学基金（82160104）
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