换一批综合分析结直肠癌异常甲基化差异表达基因
Comprehensive Analysis of Differentially Expressed Genes with Abnormal Methylation in Colorectal Cancer
摘要目的 筛选结直肠癌中甲基化调控的异常表达基因,以探讨甲基化在结直肠癌进展中的作用.方法 从基因表达综合(Gene Expression Omnibus,GEO)数据库下载并分析2个基因表达数据集(GSE25070和GSE20916)和3个甲基化数据集(GSE25062、GSE3318和GSE77718).通过蛋白互作网络分析数据库进行基因的功能和通路注释.GSE103340分析核心基因在结直肠癌不同分子亚型的表达差异.TCGA、cBioPortal数据库及生存曲线绘图仪分别用于验证核心基因、分析核心基因表达水平与结直肠癌临床病理参数、预后的关系.结果 共获得12个上调-低甲基化和73个下调-高甲基化基因,最终得到8个受甲基化调控的核心基因.KIT下调和ITPKB过表达与结直肠癌患者预后不良相关.结论 本研究通过多个生物信息学数据库的综合分析,为结直肠癌甲基化的表观遗传调控提供了新思路,对分子诊断和预后有一定的启示.
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关键词
结直肠癌甲基化分子亚型临床病理因素预后Colorectal cancerMethylationMolecular isoformsClinicopathological factorsPrognostic
分类号
R735（消化系肿瘤）
栏目名称
DOI
10.11969/j.issn.1673-548X.2025.10.012
发布时间
2025-11-27（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
基金项目
新疆维吾尔自治区自然科学基金资助项目（2022D01C820）
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