换一批急性缺氧致小鼠脑血管平滑肌功能改变的转录组学分析
Transcriptome analysis of acute hypoxia-induced functional changes in cerebrovascular smooth muscle in mice
摘要目的 探讨小鼠脑血管平滑肌细胞(CVSMCs)在低气压缺氧脑损伤中的作用及其可能的发生机制.方法 将雄性C57BL/6J小鼠随机分为平原组(Sham组)和高原组(HA组),每组10只.采用HE染色、免疫组织化学法、免疫荧光法、Western blotting观察各组小鼠脑损伤以及脑血管平滑肌功能变化情况.分离培养另20只C57BL/6J小鼠的原代CVSMCs并构建细胞缺氧模型.采用RNA-seq技术对缺氧组(Hypoxia组)和常氧对照组(Control组)的细胞进行转录组测序,筛选出差异表达基因(DEGs)后进行GO富集分析和KEGG通路富集分析,并使用qRT-PCR对测序结果的准确性进行验证.结果 模拟高原环境导致小鼠神经元损伤,并且这种损伤伴随脑血管平滑肌收缩功能改变;RNA-seq测序结果显示,Hypoxia组和Control组相比有511个DEGs(变化大于2倍;P＜0.05),其中298个上调差异基因,213个下调差异基因.GO富集分析DEGs主要富集在线粒体结构功能以及糖代谢相关途径.在KEGG通路富集分析中,糖酵解/糖异生、氨基酸生物合成、RIG-I样受体信号通路较显著(P＜0.05).结论 CVSMCs可通过改变能量代谢、物质代谢、信号传导等多个途径在低气压缺氧脑损伤中发挥作用.本研究为后续进一步研究CVSMCs在低气压缺氧脑损伤中的作用机制提供了新的方向和思路.
更多相关知识
关键词
脑血管平滑肌细胞低气压缺氧脑损伤RNA-seqGO富集分析KEGG通路富集分析cerebrovascular smooth muscle cellshypobaric hypoxic brain injuryRNA-seqGO enrichment analysisKEGG pathway enrichment analysis
分类号
R743.3
栏目名称
DOI
10.13276/j.issn.2097-1656.2024.02.014
发布时间
2024-03-22（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
基金项目
陕西省重点研发计划项目（2022SF-246）；
军队实验动物专项青年项目（SYDW(2020)23）
- 浏览10
- 被引1
- 下载9
相似文献
- 中文期刊
- 外文期刊
- 学位论文
- 会议论文
