换一批失重性骨丢失的关键调控circRNA筛选与ceRNA网络构建
CircRNA screening and ceRNA network construction for key regulation of weightlessness-induced bone loss
摘要目的 通过高通量测序(HTS)技术筛选模拟失重环境下骨髓间充质干细胞(BMSCs)中环状RNA(circRNA)的差异表达谱,对差异表达circRNA(DEcircRNA)进行生物信息学分析并进行部分验证,从分子水平探讨失重性骨丢失的可能机制.方法 利用骨形态发生蛋白-2诱导小鼠BMSCs成骨分化,分为地面对照组(Ground组)和模拟微重力组(SMG组).通过Illumina NovaSeq 6000对样本总RNA进行转录组测序并筛选与分析两组差异表达基因(DEGs),进一步构建circRNA-miRNA-mRNA相互作用的竞争性内源RNA(ceRNA)调控网络.结果 通过比较两组共鉴定出18个DEcircRNA,其中7个上调和11个下调circRNA.GO和KEGG富集分析结果显示,这些DEcircRNA的源基因主要富集在调节细胞分化和调节细胞增殖等功能,并显著富集于MAPK信号通路和细胞衰老等信号通路.CeRNA调控网络的建立可更深入了解DEcircRNA的生物学作用.通过qRT-PCR方法验证了 6个DEcircRNA,其结果与测序结果一致.结论 本研究通过HTS和生物信息学方法筛选并阐明了 18个DEcircRNA在失重性骨丢失中的潜在生物学作用,为后续研究失重性骨丢失的发生机制和临床治疗提供了新的思路.
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关键词
模拟失重失重性骨丢失骨髓间充质干细胞高通量测序circRNAsimulated microgravityweightlessness-induced bone lossbone marrow mesenchymal stem cellshigh-throughput sequencingcircRNA
分类号
R852.22（航空航天医学）
栏目名称
DOI
10.13276/j.issn.2097-1656.2025.01.004
发布时间
2025-03-19（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
基金项目
国家自然科学基金（82072475）
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