换一批利用TCGA数据集分析LncRNA LINC00319在肺腺癌中的表达及临床意义
Analysis of the expression and clinical significance of LncRNA LINC00319 expression in lung adenoarinoma utilizing TCGA datasets
摘要目的 研究长链非编码RNA(lncRNA)LINC00319在肺腺癌及其癌旁组织中的表达及临床意义.方法 从癌症基因组图谱(TCGA)数据库下载516例肺腺癌组织(肿瘤组)与59例癌旁组织(癌旁对照组)RNAseq数据及对应的肺腺癌患者临床数据,对数据中LINC00319基因表达进行分析处理.分析比较其表达与肺腺癌临床病理特征的相关性及对预后的影响.通过COX风险比例模型评估肺腺癌患者预后的独立危险因素.采用基因集富集分析(GSEA)方法预测LINC00319功能富集的分子通路.结果 LINC00319在肿瘤组中的表达水平显著高于癌旁对照组(P＜0.05),其表达水平与性别、年龄、N分期无关(P＞0.05),与吸烟、T分期、M分期以及Stage分期显著相关(P＜0.05),生存分析显示肺腺癌患者中高LINC00319表达水平预示预后差(P＜0.05).多因素COX风险比例模型结果显示,高表达水平、Ⅲ+Ⅳ及T3+T4是肺腺癌患者预后差的独立危险因素(P＜0.05).在GSEA分析中,发现LINC00319功能主要富集在细胞黏附、细胞因子相互作用、血管内皮生长因子信号通路、细胞凋亡等通路中.结论 LINC00319可能通过多种途径促进肺腺癌的发生、发展,进而影响肺腺癌患者的预后生存,因此,LINC00319可作为肺腺癌患者的预后标志物或潜在治疗靶点.
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