地黄属植物DNA条形码鉴定及地黄栽培起源研究
Identification of DNA barcoding in plants of Rehmannia Libosch.ex Fisch.et Mey.and origin of cultivated Rehmannia glutinosa
摘要目的 评价DNA条形码通用序列对地黄属植物Rehmannia Libosch.ex Fisch.et Mey.的鉴定作用,探讨中药地黄R.glutinosa的栽培起源.方法 对地黄属物种的ITS、psbA-trnH、rbcL和matK序列扩增和测序,比较各序列在种内和种间变异.采用最近距离法、相似性搜索法、构建Neighbor-Joining (NJ)系统聚类树等方法进行鉴定分析.结果 对比地黄属各种的rbcL和matK序列,结果显示rbcL序列完全一致,matK序列同源性为99.9%~100%.ITS和psbA-trnH序列的平均种间变异均大于平均种内变异,且2条序列的种间最小变异均大于种内最大变异.在ITS系统树上,地黄的所有样品与茄叶地黄聚在一支,支持率为96%;psbA-trnH和联合树上,地黄的所有样品聚为一单系分支(支持率为55%和58%).地黄与茄叶地黄聚在的这一分支分别与裂叶地黄和高地黄聚在一支(在ITS和联合树上支持率为55%和68%),与裂叶地黄和天目地黄聚在一支(在psbA-trnH树上支持率为80%).ITS和联合树支持栽培地黄的3个品种与来源于河南温县、郑州、南阳和北京野生地黄居群聚在一支,支持率为51%和69%.结论 叶绿体基因rbcL和matK不适合作为条形码对地黄属进行鉴定,ITS和psbA-trnH序列可以作为中药材地黄与同属近缘种进行鉴定的条形码序列.裂叶地黄和天目地黄可能是四倍体地黄的2个亲本来源,栽培的地黄品种可能起源于河南温县区域的野生群体.
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