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唇形科常见药用植物DNA条形码的鉴定研究

Identification of DNA barcoding of common medicinal plants in Lamiaceae

摘要目的 筛选出适合唇形科常见药用植物的DNA条形码序列.方法 通过对33种唇形科常见药用植物的核糖体ITS序列和40种唇形科常见药用植物的叶绿体matK基因进行PCR扩增和测序,用MEGA 6.0软件计算其种间、种内的Kimura 2-parameter(K2P)距离及各序列变异位点,评估序列的条形码间距(barcoding gap),采用邻接法(neighbor-joining,NU)构建系统聚类树.结果 ITS序列长度为620~698 bp,甲均(G+C)量为62.8%,叶绿体matK基因序列长度为859~932 bp,平均(G+C)量为34%,ITS序列与matK基因都有明显的barcoding gap,但matK基因的barcoding gap要小于ITS序列,从聚类分析来看,matK基因能更好地鉴定唇形科不同物种.结论 推荐matK基因序列作为唇形科植物鉴定的优选序列之一.

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中草药

中草药

2017年48卷7期

1397-1402页

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