换一批黄芩bHLH转录因子基因家族生物信息学及表达分析
Analysis of bioinformatics and expression level of bHLH transcription factors in Scutellaria baicalensis
摘要目的 通过生物信息学方法,克隆黄芩Scutellaria baicalensis bHLH基因,并初步探究其功能.方法 使用BLAST软件从黄芩cDNA文库中筛选出bHLH基因,克隆其全长cDNA序列,测序验证后使用ORF Finder预测开放阅读框,并进行蛋白序列特征分析,使用荧光定量PCR方法比较bHLH基因在不同器官以及受赤霉素刺激下的表达情况.结果 克隆的6个bHLH转录因子基因(bHLH1～3,bHLH5～7),分属6个亚家族,其中2个有完整的开放阅读框.bHLH基因相对表达水平分析发现,100 μmol/L GA3处理后bHLH2、bHLH3表达量升高,bHLH1、bHLH5～7表达量降低;bHLH基因在黄芩的根与花中表达量较高,其中bHLH1、bHLH2、bHLH5、bHLH7在花中表达量最高,bHLH3在根中表达量最高;bHLH基因与黄酮类成分生物合成及调控基因表达水平具有一定相关性.结论 为进一步完善黄芩黄酮类成分的分子调控网络奠定基础.
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关键词
黄芩bHLH转录因子生物信息学表达分析cDNA文库Scutellaria baicalensis GeorgibHLH transcription factorsbioinformaticsexpression analysiscDNA library
医学主题词
黄芩(Scutellaria baicalensis)基因(Genes)转录因子(Transcription Factors)计算生物学(Computational Biology)方法(Methods)
分类号
R282.12（中药学）
栏目名称
DOI
10.7501/j.issn.0253-2670.2018.03.024
发布时间
2018-05-09（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
基金项目
国家自然科学基金（81573522）
中央级公益性科研院所基本科研业务费专项（ZZ10-008）
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