换一批当归MADS-box生物信息学及SOC1克隆与表达分析
Analysis on MADS-box bioinformatics,SOC1 clone and expression pattern in Angelica sinensis
摘要目的 对当归Angelica sinensis MADS-box基因家族进行筛选与生物信息学分析,并对SOC1-4基因进行克隆与表达验证.方法 基于当归全长转录组筛选MADS-box基因家族,利用在线工具进行生物信息学分析,并利用qRT-PCR检测SOC1-4基因在不同材料中的表达水平.结果 当归全长转录组中含有29个MADS-box基因家族成员,可分为10个亚家族,共含有6个保守基序,蛋白质序列长度为49～422 aa,相对分子质量为5 697.56～49 624.90,等电点为5.06～11.00,亚细胞结果显示当归MADS-box基因家族成员分别定位于叶绿体、细胞核、细胞质和线粒体,二级结构预测及3D建模显示同一亚家族结构相似;SOC1-4基因克隆片段与全长转录组测序结果一致;SOC1-4基因随种苗春化作用和植株发育时期延长呈现高表达,在抽薹植株、茎和叶中高表达,而在冷冻规避春化作用种苗中呈现低表达.结论 当归含有29个MADS-box成员,各成员理化性质和结构存在一定的差异,SOC1-4基因表达水平与当归抽薹开花生理调控一致,为当归MADS-box基因家族调控抽薹开花相关研究提供借鉴.
更多相关知识
分类号
R286.12（中药学）
栏目名称
DOI
10.7501/j.issn.0253-2670.2023.05.022
发布时间
2023-04-28（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
基金项目
- 浏览4
- 被引4
- 下载0
相似文献
- 中文期刊
- 外文期刊
- 学位论文
- 会议论文
