换一批
换一批北柴胡特异DNA条形码筛选及种质资源鉴定
Screening of specific DNA barcoding and identification of germplasm resources of Bupleurum chinense
摘要目的 基于北柴胡Bupleurum chinense叶绿体基因组筛选特异性DNA条形码,并利用特异DNA条形码鉴定不同产地北柴胡种质资源.方法 利用Illumina HiSeq X Ten平台对北柴胡进行叶绿体基因组测序,利用mVISTA软件和核酸多样性分析筛选特异性片段,基于特异性片段进一步分析不同产区北柴胡样品单倍型.结果 不同产地3份北柴胡叶绿体基因组全长为155 557～155 959 bp,均呈现典型的环状四分体结构,均编码131个基因.trnV-UAC、trnC-GCA_petN、petN_psbM、ndhF_rpl32可以作为潜在的北柴胡种质资源鉴定的特异性DNA条形码.基于扩增效率,选择petN_psbM和ndhF_rpl32对来自4省7个产地177份北柴胡样品进行序列分析,结果表明petN_psbM和ndhF_rpl32分别有91和78个变异位点,分别鉴定到28、29个单倍型;两段序列联合分析形成40个单倍型(Hap1～Hap40),各单倍型的遗传距离为0～0.022.6个产地拥有特有单倍型,可以将不同产地的北柴胡种质资源进行区分.结论 利用比较叶绿体基因组学筛选的特异DNA条形码petN_psbM和ndhF_rpl32可以用于北柴胡种内种质资源鉴定,为后续鉴定北柴胡的产地来源、种质资源保护利用和育种等工作奠定基础.
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关键词
北柴胡叶绿体基因组序列对比种质资源DNA条形码Bupleurum chinense DC.chloroplast genomesequence comparisongermplasm resourcesDNA barcoding
分类号
R286.12
栏目名称
药材与资源
DOI
10.7501/j.issn.0253-2670.2023.17.023
发布时间
2023-10-20
基金项目
北京市科委基金
北柴胡精准药材批次分子防伪技术研究项目
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