摘要目的 利用串联质谱标签(tandem mass tags,TMT)定量蛋白质组学技术研究痹祺胶囊治疗类风湿性关节炎(rheumatoid arthritis,RA)的作用机制.方法 建立Ⅱ型胶原蛋白诱导的RA大鼠模型,并给予痹祺胶囊进行干预,取对照组(C)、模型组(M)、痹祺胶囊0.4g/kg给药组(BQ)的左膝关节组织,采用TMT定量蛋白质组学技术分析鉴定各组大鼠膝关节组织中的蛋白,以表达差异倍数≥1.2或差异倍数≤0.83且P＜0.05筛选MvsC、BQ vs M、BQ vs C差异表达蛋白,并分析经痹祺胶囊干预后有回调趋势的差异表达蛋白.最后通过GeneCards、OMIN数据库检索RA疾病靶点,与回调蛋白进行交集分析得到与RA疾病相关的回调蛋白,对其进行基因本体(geneontology,GO)功能和京都基因与基因组百科全书(Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)通路富集分析,明晰痹祺胶囊对RA的作用机制.结果 经痹祺胶囊干预后有121个差异蛋白具有回调趋势,其中38个与RA疾病相关,如β2整合素(integrin subunit beta 2,1TGB2)、钙调蛋白 2(calmodulin2,CALM2)、钙调磷酸酶 B 亚基(calcineurinsubunit B type 1,PPP3R1)、前列腺素合成酶(prostacyclin synthase,PTGIS)等.生物信息学分析发现这些回调蛋白参与了与RA相关的多条信号通路,如ITGB2参与调节RA及白细胞跨内皮细胞迁移信号通路;CALM2、PPP3R1通过调节钙信号通路,进而调节T细胞、B细胞受体信号通路、T细胞分化及破骨细胞分化等信号通路;PTGIS参与花生四烯酸代谢途径等.结论 痹祺胶囊可能通过干预ITGB2、PPP3R1、CALM2、PTGIS等蛋白的表达,调节了与RA相关的多条信号通路,发挥免疫抑制、抗炎、活血、抑制骨破坏和骨吸收、抑制血管翳生成等多方面药理作用,从而达到治疗RA的效果.