EFEMP1通过肿瘤微环境促进胃癌的生长与转移
Growth and metastasis of gastric cancer promoted by EFEMP1 through the tumor microenvironment
摘要目的 基于生物信息学分析EFEMP1在胃癌组织中表达及意义.方法 利用GEO数据库胃癌数据集采用CIBERSORT 和 ESTIMATE 计算方法计算 374 例胃癌病人肿瘤组织 ImmuneScore,StormalScore 和 ESTIMATEScore,通过生存分析,蛋白互作网络(PPI)构建寻找与预后相关的核心基因,并利用TCGA胃癌数据库和免疫组化染色验证核心基因表达.结果 GEO和TCGA数据库中EFEMP1在正常组织和肿瘤组织中表达无差异性,与胃癌的生存时间和临床分期相关(T和Stage).GSEA显示EFEMP1高表达主要富集于钙信号通路、细胞黏附和细胞外基质受体相互作用通路.EFEMP1表达与ITGB1在肿瘤直径、组织学分级、TNM分期均相关(P<0.05).结论 EFEMP1参与胃癌的发生、发展,在侵袭和转移中可能和ITBG1表达存在协同作用.
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