换一批基于吸头式免离心法提取石蜡包埋组织DNA的效果评价
Extraction of DNA from paraffinembedded tissues using pipette tip-based non-centrifugation method
摘要目的 评价基于吸头式免离心法(简称吸头式)提取石蜡包埋组织(FFPE)DNA的应用效果.方法 收集42例石蜡包埋组织样本,采用吸头式免离心法和离心柱法进行DNA提取,对比两种方法提取DNA浓度,纯度,质量及下游基因检测的差异.结果 分光光度计检测显示:吸头式提取DNA平均浓度为18.80 ng/μL,低于离心柱法的84.01 ng/μL,吸头式和离心柱法的A260/A280平均值分别为1.900和1.845,两种方法所提取DNA浓度及A260/A280差异具有统计学意义(P＜0.01);Qubit检测结果显示:吸头式提取DNA平均浓度为8.26ng/μL,低于离心柱法的35.56 ng/μL,两者差异具有统计学意义(P＜0.01);吸头式和离心柱所提取的DNA的N/Q平均值分别为2.631±0.839和2.558±0.782,两者差异无统计学意义(P＞0.05);吸头式提取的DNA质量与离心柱方法结果无明显差异;吸头式基因检测结果与离心柱法符合度为100％,两者EGFR基因检测外控CT值分别为27.82±1.52和27.89±1.26,KRAS/NRAS/BRAF基因突变联合检测外控CT值分别为17.52±0.80和17.29±0.93,差异均无统计学意义(P＞0.05).结论 吸头式提取的DNA浓度和纯度不及离心柱法,但其DNA质量与离心柱法无差别,能满足基因检测要求,且提取简单快速,适用于分子病理检测.
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分类号
R361.2（病理学）
栏目名称
DOI
10.3969/j.issn.1007-8096.2025.08.019
发布时间
2025-09-18（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
基金项目
德阳市科技计划项目（2022SCZ050）
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