1例早期HIV感染者体内病毒准种的各基因片段分析
Analysis of HIV quasispecies according to different gene regions during primary HIV-1 infection
摘要目的 比较1例早期艾滋病病毒(HIV)感染者体内病毒不同基因片段准种复杂度.方法 使用套式聚合酶链反应(Nested-PCR),扩增HIV感染者外周血淋巴细胞中病毒的gag、pol、vif-vpr和env区的部分基因,通过克隆、测序方法观察该感染者体内病毒准种分布情况,比较不同基因片段检测病毒准种的可靠性.结果 不同基因片段检测病毒准种结果显示,该早期感染者体内的病毒不同基因片段显示的准种基因离散率不同,其中gag区显示出的病毒准种复杂度最高,反映为该区段病毒准种的基因离散率最高,为0.008;其他各区基因(pol、vif-vpr、env)的离散率依次为0.006、0.001、0.000.结论 该HIV感染者体内病毒准种的基因中,gag区基因的突变率较高,提示Gag在机体感染HIV早期承受的免疫压力较高,因此在病毒准种研究中,gag区应该作为重要的基因区域.
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