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利用苯肾上腺素诱导新生大鼠心肌细胞肥大基因表达谱构建其调控网络

Construction of a genomic regulatory network based on gene expression profile of neonatal hypertrophic cardiomyocytes induced by phenylephrine

摘要目的:利用心肌肥大病理过程中基因表达谱的变化,构建基因/蛋白质调控网络.方法:以苯肾上腺素诱导新生大鼠心肌细胞肥大为模型,在分析肥大心肌细胞基因表达谱变化的基础上,进一步利用Pathwaystudio和Agilent Literature Search软件结合文献挖掘方法,构建基因/蛋白质相互作用网络.结果:构建的网络包含450个相互作用的基因/蛋白质(节点)以及592个它们之间相互作用的关系(边).拓扑分析表明该网络具有无尺度特性,同时分析确定14个基因/蛋白质是网络的关键节点.通过GO (gene ontology)分析,发现在苯肾上腺素诱导新生大鼠心肌细胞肥大的过程中,与物质代谢、细胞信号转导及细胞骨架等密切相关的基因可能发挥了重要作用.结论:构建基因/蛋白质网络为研究心肌肥大的分子机制提供了有用的信息和方法.

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中国病理生理杂志

中国病理生理杂志

2009年25卷11期

2081-2087页

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