基于网络药理学探讨宣肺清热方治疗COVID-19的分子机制
Exploration of the mechanism of Xuanfei Qingre Recipe in treating COVID-19 based on network pharmacology
摘要目的 基于网络药理学探讨宣肺清热方治疗新型冠状病毒感染(COVID-19)的潜在作用机制.方法 通过中药系统药理学数据库和分析平台(TCMSP)数据库获取宣肺清热方的活性成分及相关作用靶点;通过基因卡片(GeneCards)、在线《人类孟德尔遗传》(OMIM)、药物银行(DrugBank)数据库获取COVID-19 的主要作用靶点;获得宣肺清热方与COVID-19 共同靶点并制作韦恩图(Venn Diagram);利用基因/蛋白质互相作用检索分析工具(STRING)进行蛋白质-蛋白质相互作用(protein-protein interaction,PPI)分析,构建PPI网络;通过Metascape平台进行基因本体论(GO)功能富集和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析,采用Cytoscape 3.9.0 软件构建"宣肺清热方-活性成分-共同靶点-COVID-19-信号通路"网络.结果 经筛选后获得宣肺清热方活性成分 121 个、靶点 232 个,COVID-19 靶点 2 255 个及药物-疾病共同靶点 68 个,度值(Degree)最大的 10 个活性成分为槲皮素、山奈酚、木犀草素、β-谷甾醇、豆甾醇、柚皮素、异鼠李素、汉黄芩素、黄芩素和光甘草定,GO及KEGG富集分析结果主要涉及炎症-免疫调节、胞内信号转导、基因调控等多种生物学途径以及癌症通路、白细胞介素-17(IL-17)信号通路、腺苷酸活化蛋白激酶(AMPK)信号通路、钙信号通路、p53 信号通路、过氧化物酶增殖物激活受体(PPAR)信号通路等.共同靶点根据度值排名,前 10 位是雄激素受体(AR)、一氧化氮合酶 2(NOS2)、电压门控钠通道 5α(SCN5A)、RELA、蛋白激酶B(AKT)1、B淋巴细胞瘤 2(BCL2)、肿瘤坏死因子(TNF)、丝裂原激活蛋白激酶 1(MAPK1)、核因子κB抑制剂α(NFKBIA)、白细胞介素-6(IL-6).结论 宣肺清热方中主要化学成分可能作用于多靶点多通路介导炎症-免疫调节等生物学过程,发挥治疗COVID-19 的作用.
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