微卫星不稳定性结直肠癌14 239例患者的分子特征

Molecular characteristics of 14 239 patients with microsatellite instability colorectal cancer

导出学术成果认领

摘要目的对四川地区结直肠癌患者进行基因测序,以分析其微卫星不稳定(MSI)的分子特征.方法采用第二代测序技术(NGS)方法对2017年至2022年四川省成都市第三人民医院14 239例结直肠癌患者的进行检测,包含单核苷酸位点变异(SNV)、插入和缺失(InDel)、拷贝数变异(CNV)、基因融合(fusion)、MSI、肿瘤突变负荷(TMB)、EB病毒(EBV)等.比较高度微卫星不稳定(MSI-H)患者(MSI-H组,n=1 018)和微卫星稳定(MSS)患者(MSS组,n=13 221)的临床及分子特征.结果 MSI在结直肠癌中的发生率为7.15％,且MSI检出率在诊断年龄、肿瘤位置、样本类型等方面均存在差异.MSI-H组TMB显著高于MSS组(92.8突变/Mb vs 12.7突变/Mb,P＜0.05).结直肠癌患者EBV阳性率为0.43％(27例),而MSI-H未检测到有EBV阳性的患者.ERBB2、PIK3CA 和BRAF等在 MSI-H 组中的频率都明显更高,但 APC(51.26％vs 70.76％,x2=168.823,P＜0.01)、TP53(27.76％vs 69.54％,x2=739.882,P＜0.01)、NRAS(1.86％vs 3.98％,x2=11.445,P＜0.01)在 MSS 组中的阳性率更高.此外,携带一个DNA错配修复基因(MMR)变异的患者在MSI-H型中占比更高(P＜0.05).结论四川地区结直肠癌MSI-H型与MSS型具有不同的分子特征,且在TMB及EBV感染也有所差异.