山羊DPYD和NAV3基因多态性与产羔性能的关联分析
Association Analysis on Polymorphism of DPYD and NAV3 Genes and Kidding Performance in Goats
摘要为分析二氢嘧啶脱氢酶(DPYD)和神经导航因子3(NAV3)基因的单核苷酸多态性与山羊产羔性能的关联性,通过MassARRAY?SNP分型技术对DPYD基因和NAV3基因的4个候选位点进行分型,探究其在云上黑山羊、济宁青山羊、辽宁绒山羊3个群体中的遗传学特征,并统计其与云上黑山羊的产羔性能(产羔数、初生窝重、断奶窝重)的关联程度.群体遗传学分析表明,DPYD基因g.74670682 C>T位点和NAV3基因g.7247898 A>G位点在云上黑山羊、济宁青山羊、辽宁绒山羊中为低度多态(PIC<0.25);NAV3基因g.7078872 G>C位点在云上黑山羊和济宁青山羊中为低度多态,而在辽宁绒山羊中为中度多态(0.25<PIC<0.5);NAV3基因g.7350407 T>C位点在云上黑山羊和济宁青山羊中为中度多态,而在辽宁绒山羊中为低度多态.卡方检验表明,NAV3基因g.7247898 A>G位点在济宁青山羊、辽宁绒山羊中处于Hardy-Weinberg不平衡状态(P<0.05);NAV3基因g.7350407 T>C位点在云上黑山羊、济宁青山羊中处于Hardy-Weinberg不平衡状态(P<0.05),其余位点均处于Hardy-Weinberg平衡状态(P>0.05).云上黑山羊的关联分析结果显示,DPYD基因g.74670682 C>T位点对产羔数无显著影响(P>0.05);NAV3基因g.7078872 G>C位点和g.7247898 A>G位点对产羔数、窝重均无显著影响(P>0.05);NAV3基因g.7350407 T>C位点对产羔数无显著影响(P>0.05),对窝重有显著影响(P<0.05);NAV3基因g.7350407 T>C位点中CC基因型个体的初生窝重显著高于CT基因型和TT基因型个体(P<0.05),TT基因型个体的初生窝重显著高于CT基因型个体(P<0.05),CC基因型个体的断奶窝重显著高于CT基因型个体(P<0.05).综上所述,NAV3基因g.7350407 T>C位点适合作为云上黑山羊窝重选择的分子标记.
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