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牛GDF8基因编码蛋白结构和功能预测

Structure and Function Prediction of Bovine GDF8 Encoding Protein

摘要旨在探究GDF8基因(Growth differentiation factor 8)编码蛋白的结构和功能,对后期研究其生理机制提供理论依据.利用生物信息学技术对牛GDF8蛋白二级和三级结构进行了预测,分析了保守结构域、信号肽剪切位点、理化性质、亲疏水性、亚细胞定位和蛋白网络通路.结果显示,牛GDF8蛋白与人和小鼠具有相似的保守结构域,不稳定指数85.52,属于不稳定蛋白,其亲水性氨基酸明显多于疏水性氨基酸,为亲水性蛋白;牛GDF8蛋白在内质网分布的概率44.4%,在线粒体分布的概率33.3%,二级结构以无规则卷曲为主,折叠缠绕后形成三级结构;牛GDF8蛋白PPI网络图有11个节点,其KEGG通路主要与骨骼肌纤维发育、活化素受体信号通路、成肌细胞融合等相关.综上,推测GDF8蛋白存在于内质网和线粒体中,通过与亲水性蛋白结合调节机体生物学功能.

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作者 赵拴平 [1] 金海 [1] 徐磊 [1] 贾玉堂 [1] 学术成果认领
作者单位 安徽省农业科学院畜牧兽医研究所,畜禽产品安全工程安徽省重点实验室,合肥 230031 [1]
分类号 S823.2
栏目名称 研究论文
DOI 10.3969/j.issn.2095-3887.2023.02.006
发布时间 2023-04-06
基金项目
国家自然科学基金 安徽省科技重大专项
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