换一批大肠杆菌OmpC响应银胁迫初探及生物信息学分析
Preliminary study and bioinformatics analysis of E.coli OmpC response to silver ions stress
摘要通过同源重组技术敲除大肠杆菌(Escherichia coli,E.coli)外膜孔蛋白C(outer membrane porin channel C,OmpC)编码基因ompC、OmpF编码基因ompF和PhoE编码基因phoE.连续监测ompC缺失株的生长及其对银离子的敏感性;运用生物信息学分析OmpC的生物学特性.结果显示ompC、ompF和phoE缺失株构建成功,ompC、ompF和phoE缺失并不影响E.coli的生长代谢.相比于其他孔蛋白,OmpC蛋白缺失可显著提高E.coli抵御银离子胁迫的能力,与耐抗生素存在差异.生物信息学分析结果表示,OmpC的分子式为C1795H2676N482O577S4,由 367个氨基酸组成,相对分子质量为 40368.12,原子总数为 5534,等电点为 4.58;含有跨膜域,定位于细胞外膜中;二级结构中α-螺旋占比 18.80%,β-折叠占比 29.16%,β-转角占比 6.81%,无规则卷曲占比 45.23%;与银离子进行分子对接预测显示无对接位点.这为OmpC主要作为银离子入胞通道提供更多证据,可为解析E.coli应对银离子胁迫的机制奠定基础.
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关键词
大肠杆菌λRed同源重组技术银离子OmpC生物信息学分析Escherichia coliλRed homologous recombination technologysilver ionsOmpCbioinformatics analysis
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DOI
10.11857/j.issn.1674-5124.2023100026
发布时间
2025-05-08（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
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