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鼠疫菌MLVA分型技术及其应用

摘要鼠疫耶尔森菌(Yersinia pestis)是鼠疫的病原菌,鼠疫曾在历史上引发3次世界范围的大流行,给人类和社会发展造成极其严重的影响.近年来,鼠疫仍在动物和人群间有散在流行,因此,世界卫生组织(WHO)已将其列为近20年来重新流行的急性传染病之一.鼠疫菌可分为4个古老的变种,即古老变种(Antiqua)、中世纪变种(Medievalis)、东方变种(Orientalis)及田鼠型(Microtus).根据生化特性以及地理区域的差异,中国的鼠疫菌分为18个生态型[1].随着分子生物学的发展,从基因的角度对鼠疫菌进行分型已成为可能.近年来,有很多分子生物学方法被用于鼠疫菌的分型研究,任何分子分型方法都是建立在病原菌一定的基因组结构特点上.由于指纹图谱的溯源优势使其得以有效推广也因此衍生出大量分型方法[2-3].但是,每种方法各有利弊,实验需综合考虑分型能力、重复性、结果解读、可操作性和经费预算等诸多因素.任何实验方法都是为了服务实验目的,传统的诊断方法存在许多弊端,例如:耗时、低通量、重复性差等缺点.分子分型以其高通量著称,实验结果易于重复,省时、省力,相对多位点序列分析(MLST)和脉冲场凝胶电泳(PFGE)而言,多位点可变数目串联重复序列分析(MLVA)具有显著的低廉、省时的优势,因此,非常适合基层工作开展和普及.例如:核糖体分型(Ribotyping)、插入序列100(IS100)、限制性长度多态性(RFLP)、随机扩增多态性DNA(RAPD)、PFGE、MIST、规律成簇的间隔短回文重复分析(CRISPRs)和MLVA[4-9]等,都已经获得了预期的结果.本文中,作者将详细介绍有关MLVA方法的原理、研究进展以及应用前景等.