换一批H9亚型禽流感病毒钦州株HA基因的克隆与遗传进化
Cloning and phylogenetic analysis of HA gene of an avian inlfuenza virus H9 subtype isolate from Qinzhou of Guangxi
摘要采集钦州活禽交易市场的鸡气管和泄殖腔的棉拭子样品，用H9亚型分型引物进行PCR初步筛选，阳性样品经SPF鸡胚尿囊腔接种分离病毒，通过RT-PCR方法扩增HA基因，并将其克隆到pMD-18T载体后进行序列测定和分析。结果表明，获得1株H9亚型禽流感病毒命名为：A/Chicken/Guangxi/qz40/2009（简称qz40）。测序结果表明qz40的HA基因片段全长1683bp，编码560个氨基酸；序列同源性比较结果表明，该毒株与参考毒株的核苷酸序列同源性为82.8%-99.9%，推导氨基酸同源性为87.5%-99.6%；HA基因的裂解位点氨基酸顺序为RSSR↓GLF，为低致病性毒株；含有7个潜在的N-糖基化位点，其中5个位于HA1部分、2个位于HA2部分；基于H9亚型HA基因的进化树分析表明，qz40株属于欧亚种系的A/Chicken/Beijing/1/94（Ck/Bei-like）群系。
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