虾肝肠胞虫芯片式数字PCR定量检测方法的建立及应用
Establishment and Application of a cdPCR Assay for Enterocytozoon hepatopenaei
摘要虾肝肠胞虫(Enterocytozoon hepatopenaei,EHP)感染是目前对虾行业面临的全球性挑战,在过去 10年中其发病率急剧上升.为建立一种可绝对定量检测EHP的方法,根据GenBank中EHP胞壁蛋白SWP基因保守区域,设计一套特异性引物和荧光探针,通过优化反应条件,建立了EHP芯片式数字PCR(chip digital PCR,cdPCR)定量检测方法.结果显示:该方法线性关系良好(R2=0.998 1);敏感性高,检测限可达4.4 copies/μL;特异性强,与其他对虾常见病原无交叉反应;重复性良好,批内重复与批间重复试验的变异系数均小于 8%.采用建立的cdPCR方法对 28 份临床虾样品进行检测,结果发现,该方法与水产行业标准《虾肝肠胞虫病诊断规程》(SC/T 7232-2020)中套式PCR方法检测结果符合率为 100%.结果表明,本研究建立的EHP cdPCR定量检测方法线性好、灵敏度高、特异性强,重复性及准确性良好,且能绝对定量,具有较好的应用前景.
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