我国4株野鸟源新城疫病毒的基因组特性

Genomic Characterization of 4 Strains of Newcastle Disease Viruses Derived from Wild Birds in China

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摘要为了解我国野鸟源新城疫病毒(Newcastle disease virus,NDV)的基因组特性,对2023年从宁夏、湖北和福建等地野鸟样品中分离出的4株NDV进行基因组序列分析和遗传进化分析.结果显示:4株NDV分离株中,3株属于Class Ⅰ,1株属于Class Ⅱ;3株Class Ⅰ分离株基因组长度均为15 198 nt,其F蛋白裂解位点序列均为112ERQERL117,1株Class Ⅱ毒株基因组长度为15 186 nt,其F蛋白裂解位点序列为112GKQGRL117;4株NDV分离毒株皆符合弱毒株的分子特征.对4株分离株的F和HN基因推导的氨基酸序列分析发现,相较于大多数的NDV Class Ⅰ与Class Ⅱ分离株,4株分离株在F蛋白的信号肽区(TM)、融合肽区、七肽重复区(HR)及HN蛋白的N端跨膜区和柄部区(HR)分别有多处氨基酸变化.与NCBI中代表株的F基因进行同源性分析发现,2株Class Ⅰ分离株与1.2亚型代表株同源性最高,1株Classi分离株与1.1.2亚型代表株同源性最高,1株Class Ⅱ分离株与基因1.2亚型代表株同源性最高.遗传进化分析发现,2株分离株属于Class Ⅰ基因1.2亚型,1株属于Class Ⅰ基因1.1.2亚型,1株属于Class Ⅱ基因Ⅰ型.结果表明,我国野鸟中存在Class Ⅰ、Class Ⅱ弱毒型毒株流行且其F、HN基因已发生部分突变,这为进一步了解我国野鸟源NDV生物学特性奠定了基础.

作者张昕悦 ^[1] 朱明慧 ^[2] 王海鸣 ^[3] 陈璐 ^[4] 刘朔 ^[4] 于晓慧 ^[4] 刘玉峰 ^[2] 陈雨腾 ^[5] 李阳 ^[4] 范春艳 ^[6] 王静静 ^[7] 刘华雷 ^[4] 学术成果认领

作者单位河北工程大学生命科学与食品工程学院,河北邯郸 056038;中国动物卫生与流行病学中心,山东青岛 266032 ^[1] 中国动物卫生与流行病学中心,山东青岛 266032;青岛农业大学,山东青岛 266109 ^[2] 中国动物卫生与流行病学中心,山东青岛 266032;宁夏大学,宁夏银川 750000 ^[3] 中国动物卫生与流行病学中心,山东青岛 266032 ^[4] 中国动物卫生与流行病学中心,山东青岛 266032;山东农业大学,山东泰安 271018 ^[5] 河北工程大学生命科学与食品工程学院,河北邯郸 056038 ^[6] 中国动物卫生与流行病学中心,山东青岛 266032;农业农村部动物生物安全风险预警及防控重点实验室(南方),山东青岛 266032 ^[7]

关键词新城疫病毒基因组特性基因序列分析野鸟 NDV genomic characteristic gene sequence analysis wild bird

分类号 S851.3

栏目名称 流行病学

DOI 10.3969/j.issn.1005-944X.2024.12.003

发布时间 2025-02-18

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