四川省部分规模化猪场PEDV检测和基因序列分析
Detection and Genetic Sequence Analysis of Porcine Epidemic Diarrhea Virus on Selected Large-scale Swine Farms in Sichuan Province
摘要为了解四川省猪流行性腹泻病毒(porcine epidemic diarrhea virus,PEDV)的流行特征和遗传变异情况,2024-2025年从四川省12个地区18家规模化养猪场共收集123份猪腹泻粪便样品,采用荧光定量RT-PCR方法进行PEDV核酸检测,检出105份阳性,样品阳性检出率为85.37%,场阳性检出率为100%;通过高通量测序方法成功获得8份PEDV完整基因组序列,分别来自8个地区.对全基因序列和S基因序列进行遗传进化分析发现:8份序列分属于G2c(5份)、G2b(2份)、S-INEDL(1份)亚型;8份序列翻译的S蛋白序列均存在多处氨基酸突变.研究表明:PEDV是导致四川省规模化猪场猪腹泻的主要病原,且多基因型并存流行,但G2c亚型为优势流行基因型;S蛋白关键抗原位点的多处突变可能导致现有疫苗保护效力下降.因此,应继续加强PEDV监测,尽快研发包括针对G2c型毒株在内的新型广谱疫苗,以遏制PEDV的持续流行.
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