广东省深圳市屠宰猪群PRRSV ORF5、ORF7、Nsp2基因遗传变异分析
Genetic Variation Analysis of PRRSV ORF5,ORF7 and Nsp2 Genes in Pigs for Slaughter in Shenzhen City,Guangdong Province
摘要为明确广东省深圳市屠宰猪群中猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)的隐性带毒状况及流行毒株的遗传变异特征,2023-2024年从深圳市4家生猪屠宰场采集490份淋巴结样品,采用qRT-PCR方法进行PRRSV核酸检测;对阳性样品的ORF5、ORF7和Nsp2基因进行扩增测序,利用MegAlign软件将所得序列与GenBank参考株/流行株进行多序列比对,并构建系统进化树分析遗传进化关系.结果显示:共检出阳性样品69份,其中67份为单一美洲型PRRSV阳性,2份为美洲型与欧洲型PRRSV混合阳性;最终获得19条ORF5、39条ORF7和21条Nsp2基因序列.ORF5的核苷酸和编码氨基酸序列与参考株同源性分别为60.3%~99.67%和51.5%~99.0%,归类为PRRSV-2-Lineage 8/SubLineage 8.7和PRRSV-2-Lineage 1/SubLineage 1.8谱系,对应类JXA1(JXA1-like)和类NADC30(NADC30-like)毒株;ORF7的核苷酸序列与参考株同源性为77.98%~97.98%,大部分也归属于PRRSV-2-Lineage 8/SubLineage 8.7和PRRSV-2-Lineage 1/SubLineage 1.8谱系,为类JXA1 和类NADC30毒株,少部分与PRRSV-2-Lineage 3遗传距离较近;Nsp2的核苷酸序列与参考株同源性为62.97%~99.13%,归类为Lineage 8谱系.此外,由ORF5编码的GP5蛋白多个序列在其信号肽区域发生了氨基酸突变.基于ORF5、ORF7和Nsp2基因的遗传进化分析发现,不同基因对应的毒株谱系分布存在差异.综上所述,深圳市屠宰场屠宰猪群存在PRRSV隐性感染情况,感染毒株以类NADC30为主,且不同毒株间的基因序列存在一定差异,提示可能存在毒株重组事件.本研究为PRRS的精准防控提供了重要的分子流行病学支撑.
更多相关知识
- 浏览2
- 被引0
- 下载0

相似文献
- 中文期刊
- 外文期刊
- 学位论文
- 会议论文


换一批



