基于公共数据库探讨DDB1在肺腺癌中的表达和作用
Public Database-based Study to Explore the Expression and Role of DDB1 in Lung Adenocarcinoma
摘要背景与目的 肺腺癌(lung adenocarcinoma,LUAD)是非小细胞肺癌(non-small cell lung cancer,NSCLC)的主要亚型.损伤特异性DNA结合蛋白 1(damage-specific DNAbinding protein 1,DDB 1)作为CUL4-DDB1 泛素连接酶复合体的核心蛋白,参与调控DNA损伤修复、表观遗传修饰及细胞周期检查点激活等关键生物学过程.有报道DDB1通过DNA修复与RNA转录调控参与肿瘤进展,但其在LUAD中的表达及作用尚不明确.本研究旨在探讨DDB1在LUAD中的表达和作用.方法 利用UALCAN、Kaplan-Meier Plotter、GEPIA等数据库,对DDB1在LUAD中的表达及预后、临床病理特征等进行分析;通过GeneMANIA和Metascape构建相互作用网络及富集功能通路;结合TISIDB评估DDB1与免疫细胞浸润相关性,通过单细胞测序对细胞亚型的聚类结果和DDB1在不同免疫细胞亚群中的表达情况进行分析;最后,利用组织芯片进一步验证DDB1在LUAD中的表达及预后价值.结果 DDB1在LUAD组织中的表达显著高于正常组织(P<0.01),且高表达与肿瘤原发灶-淋巴结-转移(tumor-node-metastasis,TNM)分期较晚(P<0.001)、淋巴结转移(P<0.001)及预后不良(P<0.001)有关.功能富集显示DDB1参与DNA修复与RNA转录调控.TISIDB评估发现DDB1与免疫细胞的表达水平呈负相关,提示存在免疫微环境调控潜力.单细胞分析显示,DDB1主要在T细胞、肺泡巨噬细胞以及树突状细胞中表达.组织芯片证实DDB1高表达组总生存期更短(P<0.001),Cox多因素分析表明DDB1为预测LUAD预后的独立因子.结论 DDB1在LUAD中高表达,与患者预后不良有关,并且与肿瘤免疫细胞浸润密切相关,通过DNA修复与RNA转录调控参与肿瘤发生发展.DDB1可作为LUAD潜在的预后标志物及治疗靶点.
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