非小细胞肺癌中SRSF家族蛋白的表达和预后及功能分析
Expression,Prognostic and Functional Analysis of SRSF Family Proteins in Non-small Cell Lung Cancer
摘要背景与目的 非小细胞肺癌(non-small cell lung cancer,NSCLC)是全球癌症相关死亡的主要原因之一,其发生发展与复杂的分子机制密切关联.前体mRNA选择性剪接的异常在肿瘤中普遍存在,丝氨酸/精氨酸富集剪接因子(serine and arginine rich splicing factor,SRSF)家族是该过程的核心调控者.然而,目前对于SRSF家族在NSCLC中的系统性研究仍不充分.本研究旨在通过生物信息学分析与实验验证相结合的方式,系统分析SRSF家族在NSCLC中的表达谱、预后价值及其潜在生物学功能.方法 本研究整合癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA)和癌细胞系百科全书(Cancer Cell Line Encyclopedia,CCLE)等公共数据库中的转录组与临床数据,分析SRSF家族在NSCLC中的差异表达.通过Kaplan-Meier生存分析评估其表达水平与患者总生存期的关系.利用基因本体(Gene Ontology,GO)及京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)通路富集分析探讨其功能.进一步收集临床样本和细胞系,通过逆转录定量聚合酶链反应(reverse transcription quantitative polymerase chain reaction,RT-qPCR)、细胞计数试剂盒-8(cell counting kit-8,CCK-8)及细胞增殖实验验证关键成员的表达与功能.结果 SRSF家族多个成员(如SRSF1、SRSF2、SRSF3、SRSF6、SRSF7、SRSF9、SRSF10等)在NSCLC组织及细胞系中显著高表达.生存分析表明,SRSF9的高表达与患者不良预后有关,而SRSF11和SRSF12的低表达提示预后较差.功能富集分析揭示,SRSF家族不仅参与RNA剪接,还显著富集于蛋白质稳态、细胞应激反应及神经退行性疾病相关通路.体外实验证实,敲低SRSF1、SRSF2、SRSF6、SRSF9、SRSF10可显著抑制NSCLC细胞的增殖能力.结论 本研究系统描绘了SRSF家族在NSCLC中的表达与功能图谱,证实了其作为预后生物标志物和治疗靶点的潜力.本研究提示,SRSF家族可能通过破坏细胞稳态(如蛋白质稳态与应激反应)这一在肿瘤发生中至关重要的环节来驱动NSCLC的进展,为深入理解剪接失调在肺癌中的作用及开发新型治疗策略提供了理论依据.
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