宏基因组纳米孔测序在结核浆液性积液诊断及合并感染筛查中的应用价值
The application value of nanopore sequencing in the diagnosis of tuberculous serous effusion and screening for coinfections
摘要目的:探究宏基因组纳米孔测序(简称"纳米孔测序")技术在结核浆液性积液诊断中的应用价值,并评估其在快速、精准鉴定结核分枝杆菌及筛查合并感染病原体方面的优势.方法:纳入2021年10月至2025年5月在南宁市第四人民医院就诊的疑似结核浆液性积液患者,采集其积液样本进行纳米孔测序,以最终临床诊断结果为参考标准,与传统检测方法(包括抗酸染色、TB-DNA检测、GeneXpert MTB/RIF和分枝杆菌固体培养)进行对比分析.结果:纳米孔测序技术的敏感度(73.1%,19/26)、特异度(100.0%,27/27)、阳性预测值(100.0%,19/19)、阴性预测值(79.4%,27/34)、Kappa值(0.734)的总体诊断效能优于抗酸染色[敏感度为11.5%(3/26)、特异度为100.0%(27/27)、阳性预测值为3/3、阴性预测值为54.0%(27/50)、Kappa值为0.117]、培养[敏感度为30.8%(8/26)、特异度为100.0%(27/27)、阳性预测值为8/8、阴性预测值为60.0%(27/45)、Kappa值为0.312]、TB-DNA检测[敏感度为34.6%(9/26)、特异度为100.0%(27/27)、阳性预测值为9/9、阴性预测值为61.4%(27/44)、Kappa 值为 0.350]、GeneXpert MTB/RIF[敏感度为 34.6%(9/26)、特异度为 100.0%(27/27)、阳性预测值为9/9、阴性预测值为61.4%(27/44)、Kappa值为0.350]、结核抗体检测[敏感度为46.2%(12/26)、特异度为81.5%(22/27)、阳性预测值为70.6%(12/17)、阴性预测值为61.1%(22/36)、Kappa值为0.278].纳米孔测序技术还显示,结核病患者合并非结核分枝杆菌、病毒、真菌、细菌感染等的比例(42.1%,8/19)较高.结论:纳米孔测序技术在结核浆液性积液的诊断中展现出优异的性能,其诊断效能优于传统病原学检测方法,能够有效提高结核病的早期诊断率,并为合并感染的筛查提供新的解决方案.
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