基于TCGA和GEO数据库分析CENP-A在宫颈癌中的表达及临床意义
Expression and clinical significance of centromere protein A in cervical cancer based on TCGA and GEO database analysis
摘要目的 通过生物信息学的方法分析着丝粒蛋白A在宫颈癌(CC)患者中的表达及临床意义.方法 在TCGA癌症基因组图谱、GEO基因表达数据库及GEPIA、UALCAN数据库中提取CC相关的RNA测序数据,评估着丝粒蛋白A的表达及其在CC患者中的临床意义;使用R语言提取TCGA数据库中的CC患者的临床病理参数,并利用x2检验、单因素及多因素COX回归分析等检验方法对数据进行分析;使用在线工具对GEO的两个CC数据集分析,并对CENP-A进行GO功能分析.收集CC患者及健康对照患者外周血标本,qRT-PCR方法检测CENP-A mRNA表达水平的差异.结果 与正常宫颈组织相比,CC组织中的着丝粒蛋白A表达显著上调(P<0.05),CENP-A的表达量与患者的年龄、CC分期、肿瘤浸润深度、远处转移、AJCC分期及病理类型无明显关系,与淋巴结转移呈正相关(P<0.05);多因素COX回归分析显示,淋巴结转移是影响CC患者预后的独立危险因素(P<0.05);对着丝粒蛋白A进行GO功能富集分析,发现其主要富集在"有丝分裂""染色体区域"及"蛋白质结合"等.CC患者外周血有核细胞中CENP-A的含量明显高于对照组(P<0.05).结论 着丝粒蛋白A在CC组织中表达上调且与CC患者的淋巴结转移情况相关,可能为CC患者的分子诊断和治疗提供潜在的研发靶点.
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