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基于DNA甲基化的三种常见体液组织来源鉴定

Source identification of three types of body fluids based on DNA methylation

摘要目的 针对唾液、精液、外周血,找到一组可用于区分不同体液的组织差异性甲基化位点,为确定案件现场提取的体液组织来源提供科学依据.方法 选取常见体液样本共49份,运用Illumina 850K甲基化芯片进行全基因组甲基化检测,筛选获得17个候选CpG位点;使用焦磷酸测序对55份样本进行测序,实际共检测了候选位点及其附近的位点共34个CpG位点.选择基于赤池信息量(AIC)的逐步条件多分类逻辑回归方法进行数据分析.结果 基于3个CpG位点(cg25373595、cg18121066、cg17283169)构建了多分类逻辑回归模型用于体液组织来源预测,分别位于RAP1GAP2,TBCD,CALML3基因上.该模型对精液来源预测的AUC、灵敏度和特异性均为1,对唾液和静脉血来源的预测AUC和灵敏度均为1,特异性分别为0.99和0.98.在独立的唾液、精液和静脉血3种体液共24份样本中对该预测模型进行验证,预测结果全部正确.结论 本文建立的基于3个CpG位点的体液组织来源鉴定方法可以实现唾液、精液和静脉血3种体液的有效区分,在法庭科学中具有潜在的应用价值.

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作者 杨梦思 [1] 陈燕 [2] 陈静 [3] 王科文 [3] 郭向前 [1] 季安全 [3] 丰蕾 [3] 学术成果认领
作者单位 河南大学基础医学院,河南 开封175000 [1] 中国科学院北京基因组研究所,北京100101 [2] 公安部物证鉴定中心,法医遗传学公安部重点实验室,北京100038 [3]
分类号 D918.93
栏目名称 论著
DOI 10.13618/j.issn.1001-5728.2021.05.010
发布时间 2021-11-01
基金项目
"十三五"国家重点研发计划课题 中央级公益性科研院所基本科研业务费专项资金项目 法医遗传学公安部重点实验室开放课题
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