基于NGS方法构建人类STR、SNP联合检测体系及其性能研究

Construction and validation a STR/SNP multiplex detection system based on next generation sequencing

二维码有效期 120s

摘要目的使用NGS方法构建人类STR和SNP遗传标记联合检测体系,并对体系性能做出评价.方法通过两轮PCR方法构建了同时检测78个STR和233个SNP的测序文库,通过覆盖度和均衡性评价了panel体系,并且开发新的侧翼检测和分型方法从灵敏度、准确性、适用PCR机型、种属特异性、检材类型、模拟降解检材、混合样本区分、批量样本的表现等方面对体系的效能进行了研究.结果该体系表现较高覆盖度和准确性.新的分析方法,使得在真实检材样本中和CE的一致率超过99.6％.本体系适用广泛的PCR机型和多种检材类型;SNP灵敏度可达到0.1 ng,STR在投入量为0.5 ng时,检出率依然可以达到93.3％;非人物种的干扰几乎为0;能够有效的区分低频率的混合样本(低于1:19).结论上述结果表明该体系具有较好的性能,可用于法庭科学实际案件或数据库建设的检测.