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引物末端不同碱基对聚合酶链反应产物影响

Effects of different end primer bases on PCR amplification product

摘要目的 探索引物末端3'端不同碱基对聚合酶链反应产物的影响.方法 以含有乙肝病毒(HBV)完整基因组的重组质粒pUC-19为模板,利用3'端碱基分别为A,T,C,G的下游引物,在相同的上游引物和退火温度下进行聚合酶链反应.结果 不同的反应体系在相同退火温度下目的 产物和引物二聚体形成不同;A表示上游引物,P表示下游引物;下游引物共计4条,分别用P1、P2、P3、P4表示,其3'端碱基分别为T,G,A,C.上下游引物共4对,分别用AP1、AP2、AP3、AP4表示;退火温度为50℃时,AP1和AP4有明显的扩增产物,AP3扩增产物稍少,AP2产物肉眼观察不到,有非特异性产物生成;退火温度升至55℃时,AP1和AP2有明显的扩增产物,AP4少量扩增产物,P3产物肉眼观察不到,AP1和AP4反应体系引物二聚体生成情况基本相同,AP2和AP3引物二聚体生成较少;退火温度升至62℃时,AP1和AP2有明显的扩增产物,AP4扩增产物稍少,AP3产物肉眼观察不到,可观察到引物二聚体生成稍多.结论 3'端不同碱基对聚合酶链反应产物有很大影响.

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中国公共卫生

中国公共卫生

2010年26卷2期

178-179页

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