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基于R Markdown文档的疾病监测报告自动化生成方法及应用:以蚊媒监测报告为例

Automating report generation for disease surveillance data using R Markdown:a case study on mosquito surveillance data

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摘要本文提出了一种基于R Markdown文档的疾病预防控制机构监测报告自动化生成方法,以蚊媒监测报告为例,展示了从数据收集、分析、可视化到报告生成的全流程.通过整合文本、代码及输出结果,R Markdown文档显著减少了人工操作,提高了报告的准确性和可重复性.本研究首次将R Markdown文档应用于蚊媒监测报告的自动化生成,为公共卫生领域提供了一种高效、可复用的解决方案.研究结果表明,该方法能够显著提升数据处理效率、增强报告灵活性,并为决策支持提供实时、可靠的数据支持.

作者陈创端 ^[1] 肖树 ^[2] 肖建鹏 ^[3] 芦瑞鹏 ^[4] 容祖华 ^[3] 曾韦霖 ^[3] 赵建国 ^[3] 龚德鑫 ^[3] 学术成果认领

作者单位广东省普宁市疾病预防控制中心,揭阳 515300 ^[1] 暨南大学基础医学与公共卫生学院,广州 510632;广东省疾病预防控制中心广东省公共卫生研究院,广州 511430 ^[2] 广东省疾病预防控制中心广东省公共卫生研究院,广州 511430 ^[3] 广东省疾病预防控制中心消毒与病媒生物预防控制所,广州 511430 ^[4]

关键词 R Markdown文档自动化报告疾病监测蚊媒监测数据处理可视化 R Markdown automated report generation disease surveillance mosquito surveillance data processing visualization

栏目名称

调查报告与分析

DOI 10.11847/zgggws1147047

发布时间 2026-04-14（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

基金项目

广东省重点领域研发计划项目（2022B1111020006）广东省自然科学基金面上项目（2023A1515011921）