换一批骨质疏松症和动脉粥样硬化机制及"异病同治"分析
Analysis of mechanisms between osteoporosis and atherosclerosis with concept of"simultaneous treatment of different diseases"
摘要目的 通过生物信息学分析骨质疏松症(osteoporosis,OP)和动脉粥样硬化(atherosclerosis,AS)的共同基因,并根据关键基因预测具有防治作用的中药.方法 分别以osteoporosis和atherosclerosis为关键词在疾病数据库(GeneCards、DISEASES、CTD)中筛选相关基因,相互映射后获得疾病共同靶基因,应用Metascape在线网站进行GO及KEGG富集分析,并通过STRING网站和Cytoscape软件获得靶点PPI互作网络;通过CytoHubba插件获得关键基因;最后将关键基因导入医学本体信息检索数据库(Coremine Medical),预测具有防治作用的中药.结果 通过相关疾病数据库分别筛选出OP和AS的相关靶点315个、481个,映射出共同靶点202个.富集分析发现二者共同分子机制主要涉及免疫炎症反应、脂质代谢、PI3K-Akt和MAPK等相关通路.通过CytoHubba获得10个关键基因(包括CD4、TLR2、TIMP1、CCL2、APOE、GAPDH、NFKBIA、IL4、CRP和TGFB1),并预测得到黄芩、人参、丹参、三七等9味中药.结论 本研究从基因层面上探讨了OP和AS的潜在共同发病机制,并初步预测出具有防治作用的中药,可为异病同治中药开发提供靶标及研究思路.
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