整合生物信息学和实验验证研究续苓健骨方抗骨质疏松作用机制
Study of the therapeutic mechanism of Xuling Jiangu Decoction in osteoporosis based on integrating bioinformatics and experimental verification
摘要目的 系统性预测续苓健骨方治疗骨质疏松症(osteoporosis,OP)的作用机制并实验验证.方法 利用整合生物信息学方法分析药物的化合物信息及抗OP靶点、前20(TOP20)关键靶点及相关作用机制和信号通路.基于去卵巢(ovariectomy,OVX)大鼠模型,骨密度(bone mineral density,BMD)、生物力学、Micro CT、HE染色等指标验证疗效;转录组学及GO和KEGG分析初步验证机制和相关靶点;qRT-PCR和Western blot方法进一步验证关键靶点.结果 药物的144个有效成分作用于242个靶点,主要参与血管发生;刺激应答;细胞增殖、分化、凋亡、迁移和黏附;骨重建和破骨分化;物质代谢等.其中TOP20关键靶点对应10种中药的55种化学成分,骨碎补和续断的活性成分居多.药物治疗可明显改善OVX大鼠骨组织的BMD、生物力学、Micro CT下骨质量参数及骨组织形态;转录组学检测获差异表达基因679个,GO和KEGG分析其机制与整合生物信息学结果基本相符,在代谢相关信号通路方面有明显富集,TOP20靶点的表达水平均发生相应改变;qRT-PCR和Western blot结果进一步证实了Gapdh、Tnf、Spp1、Mmp2、Mmp1、Mapk3、Hif1a、Esr1等基因表达水平在造模及药物治疗前后发生了相反变化.结论 续苓健骨方药效与骨碎补和续断具有密切关系,Gapdh、Hif1a等代谢相关基因调控的代谢信号通路可能在其中发挥重要作用.
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