基于潘多拉测序探索劳力性热射病小鼠脑组织非编码小RNA的变化
Study of small non-coding RNA changes in brain tissue of exertional heat stroke mice based on Pandora sequencing
摘要目的 基于潘多拉测序探索劳力性热射病(EHS)小鼠脑组织非编码小RNAs(sncRNAs)的变化.方法 将12只雄性健康C57BL/6J小鼠随机分为对照组(n=6)和模型组(n=6).对照组小鼠不作处理,模型组小鼠采用恒温恒湿箱内跑步建立EHS模型.EHS模型建立后基于脑湿干重检测和HE染色明确EHS小鼠脑损伤.采用潘多拉测序进行组间差异sncRNAs筛选.结果 EHS小鼠脑组织通过PANDORA-Seq共检测2 722个sncRNA;与正常对照组比较,以fold change>2、P<0.05为筛选条件,EHS小鼠脑组织共鉴定到53个显著差异sncRNA,如 mmu-miR-1843b-5p、mmu-miR-490-3p、mmu-miR-1843a-5p、piR-mmu-7796454和tsRNA-1020-MetCAT等;基于小RNA注释软件SPORTS1.1发掘和注释sncRNAs,提供了长度分布图和种类分布雷达图.sncRNAs种类的差异分析和序列的差异分析结果采用热图和火山图展示.结论 sncRNAs失调可能参与EHS小鼠脑损伤的发病机制.
更多相关知识
- 浏览10
- 被引0
- 下载14

相似文献
- 中文期刊
- 外文期刊
- 学位论文
- 会议论文