换一批手足口病柯萨奇病毒A2、A4和A5型SYBR GreenⅠ实时荧光定量RT-PCR检测方法的建立
Development of a SYBR Green Ⅰ rRT-PCR assay to detect coxsackievirus strains A2, A4, and A5 in patients with hand, foot and mouth disease
摘要目的 建立一种快速、灵敏、特异的SYBR GreenⅠ实时荧光定量逆转录-聚合酶链反应(rRT-PCR)方法,以期用于检测柯萨奇病毒A2、A4和A5型. 方法 根据3种病毒vp1基因保守序列设计特异性引物,建立并优化SYBR GreenⅠ rRT-PCR方法.分别构建3种病毒的vp1部分基因的重组质粒作为病毒的体外转录标准品,分别以100～109和102～105倍稀释的标准品、其他6种肠道病毒、两种呼吸道RNA病毒及以临床诊断为手足口病的临床标本为模板,经过优化SYBR Green Ⅰ rRT-PCR反应条件,建立标准曲线和溶解曲线对其灵敏度、重复性、特异性进行评价,分析其临床应用中的效果. 结果 成功建立了3种柯萨奇病毒的SYBR GreenⅠ荧光定量rRT-PCR方法及定量标准曲线,方法的灵敏度为101copies/μ1质粒标准品,变异系数均＜2％,与柯萨奇病毒A组6、10、16型,肠道病毒EV71型,诺如病毒,轮状病毒,麻疹病毒和乙型流感病毒均无交叉反应.检测84份手足口病临床标本,阳性率分别为36.9％ (CVA4)、8.33％ (CVA5)和7.14％ (CVA2),经测序验证符合率为100％. 结论 建立的检测柯萨奇病毒A2、A4和A5型的SYBR GreenⅠ rRT-PCR方法具有良好的灵敏度、重复性和特异性,可用于手足口病病原体的分型检测.
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关键词
SYBR Green Ⅰ实时荧光定量聚合酶链反应柯萨奇病毒A2型柯萨奇病毒A4型柯萨奇病毒A5型SYBR Green Ⅰ real-time fluorescence quantitative polymerase chain reactioncoxsackievirus A2coxsackievirus A4coxsackievirus A5
栏目名称
DOI
10.13350/j.cjpb.170104
发布时间
2017-03-29（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
基金项目
国家重大传染病防治科技重大专项项目（(No.2012ZX10004209)）
天津市疾病预防控制中心科技基金项目（(No.CDCKY1303)）
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