换一批人乳头瘤病毒58型L1蛋白B细胞表位预测和分析
Prediction and analysis of the B cell epitopes of the L1 protein of HPV type 58
摘要目的 对人乳头瘤病毒58型(HPV58)主要结构蛋白(L1)的B细胞表位进行预测和分析. 方法 利用生物信息学软件EXPASY在线分析HPV58型L1蛋白的二级结构及生物学特性,包括跨膜趋势、表面可及性、抗原性、亲水性,溶性等,从而对其B细胞表位进行综合分析和预测. 结果 通过亲水性参数,Zimmcrman极性,柔韧性参数,表面可及性及抗原性进行综合分析,预测人乳头瘤病毒58型L1蛋白的B细胞表位可能位于其N端的29-37,43,46-58,64-67,74,79-88,93,100-101,103-125,133-139,149,151-180,187-213,220-213,235,238-247,252-271,277-282,286-309,320-323,327-338,341-348,351,353-368,373-396,408,427,419-425,433-444,453-468,470,475-486,488-490,493-494,497-524肽段区域;进一步用Protien Plast在线同源匹配分析,79-88、190-216、373-396、453-468、497-524肽段区段为可能的B细胞表位. 结论 用多参数预测分析HPV58型L1蛋白可能的B细胞表位,为进一步研究高危型58型L1蛋白的生物学特性提供了理论基础.
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关键词
人乳头瘤病毒58型(HPV58)B细胞表位L1蛋白同源性匹配分析Human papillomavirus type 58 (HPV58)B cell epitopeL1 proteinhomologous sequence alignment
栏目名称
DOI
10.13350/j.cjpb.170506
发布时间
2017-07-06（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
基金项目
国家自然科学基金项目（(81176423)）
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