摘要目的 比较4种全基因组扩增试剂盒对滤纸血样本中恶性疟原虫选择性全基因组扩增的性能,为恶性疟原虫全基因组研究提供参考.方法 对恶性疟患者全血样本进行梯度稀释,制备高、中、低原虫密度的滤纸血样本并提取DNA,采用Transgen、Vazyme、QIAGEN和NEB 4种全基因组扩增试剂盒进行选择性全基因组扩增(sWGA).扩增产物经酶切法构建测序文库,使用Illumina NovaSeq 6000 S4平台进行150 bp双端测序.测序数据经fastp进行质控,并以恶性疟原虫Pf3D7参考基因组进行比对,分析Mapping率、覆盖度和测序深度,同时评估Kelch13基因区域的扩增效果,使用R软件对数据分析并可视化.结果 4种全基因组扩增试剂盒均能满足测序文库构建需求,平均产生35.14M(30.21M～44.35M)有效测序reads,测序数据Q30比例均＞85％.不同试剂盒的扩增产物在测序数据质量、Mapping率、覆盖度及测序深度方面存在显著差异,且受原虫密度影响.在低原虫密度样本中,Transgen试剂盒表现最佳,其Mapping率、覆盖度及测序深度均显著高于其他试剂盒(P＜0.05).在中等原虫密度样本中,Transgen和Vazyme试剂盒的覆盖度较高(＞98％),NEB试剂盒的覆盖度波动较大(69.51(28.30)％.在高原虫密度样本中,4种试剂盒的测序数据质量差异较小,Mapping率和覆盖度均接近100％.Kelch 13基因区域的测序分析显示,Transgen试剂盒在低密度样本中的测序覆盖度最高(98.39(3.23)％,NEB和QIAGEN试剂盒的覆盖度较低,且不同试剂盒在不同原虫密度下的平均测序深度差异显著.结论 不同试剂盒对恶性疟原虫选择性全基因组扩增性能的差异较大,Transgen和Vazyme对低原虫密度的样本扩增效果均较好.