换一批
换一批新的具有高度多态性的日本血吸虫微卫星位点的鉴定
New Polymorphic Microsatellite Loci Identified Using Genomic Resource for Schistosoma japonicum
摘要目的 从基因组序列中选择和设定新的、可用于研究日本血吸虫多态性的微卫星位点.方法 672个日本血吸虫标本取自安徽、汀西、湖南、湖北和四川等5省的7个流行区现场.根据日本血吸虫基凼组数据库中的初始数据设计引物,对标本的17个全新的日本血吸虫微卫星位点进行分析.用GenMapper 4.0软件(Applied Biosystems)进行初始数据处理,用GenClone 1.0软件计算种群内各标本的遗传距离;用GenAlEx6软件统计等位基因的变化;用GenClone 1.0软件计算种群内各标本的遗传距离;用UPGMA谱系图分析种群间遗传距离.结果 17个微卫星位点均呈现多态性.对江西都吕种群的这17个位点进行分析,标本之间的遗传距离大多为25～32,显示江西都昌种群内各个标本之间的遗传差异明显.对7个地区种群分析的结果显示种群间的差异较为明显.类平均法系统聚类分析(UPGMA)谱系图显示,江两都昌、安徽铜陵、湖北沙市和湖南常德的种群同为一簇,其遗传距离为0.0178～0.036 3;安徽贵池和湖南岳阳的为另外一簇,其遗传距离为0.0247;而四川西昌单独为一簇,与其他两簇的遗传距离为0.0192～0.0693.结论 选择的17个微卫星位点可作为研究日本血吸虫种群遗传学的有效标记,并揭示中国大陆该虫种存在着复杂的遗传变异.
更多相关知识
分类号
R383.24
栏目名称
论著
DOI
10.3969/j.issn.1000-7423.2008.02.006
发布时间
2008-07-01
基金项目
热带医学研究中心项目
国家重点国际合作项目
国家高技术研究发展计划(863计划)目标导向专项
国家重点基础研究发展规划(973计划)前期项目
美国国立卫生研究院项目
- 浏览353
- 被引3
- 下载0
相似文献
- 中文期刊
- 外文期刊
- 学位论文
- 会议论文
