输入性卵形疟原虫细胞色素b、细胞色素c氧化酶Ⅰ和乳酸脱氢酶基因单核苷酸多态性分析
Single nucleotide polymorphism analysis of cytochrome b, cytochrome c oxidase Ⅰ and lactate dehydrogenase genes of imported Plasmodium ovale
摘要目的 对卵形疟原虫(Plasmodium ovale)curtisi亚种和wallikeri亚种编码的细胞色素b(cytochrome b,Cytb),细胞色素c氧化酶Ⅰ(cytochrome c oxidase Ⅰ,Cox Ⅰ)和乳酸脱氢酶(lactate dehydrogenase,LDH)基因的单核苷酸多态性进行分析. 方法 选择浙江省疟疾诊断参比实验室2011-2014年确诊的卵形疟原虫感染患者血样,提取卵形疟原虫DNA,巢式PCR扩增卵形疟原虫Cytb、Cox Ⅰ和LDH基因的部分片段,对扩增产物进行双向测序.测序序列经校对、拼接后,应用MEGA软件对测序序列和相应的氨基酸序列进行比对,分析单核苷酸多态性位点以及氨基酸突变位点. 结果 19例卵形疟原虫感染者(其中curtisi亚种11例,wallikeri亚种8例)均为赴非洲返国人员.PCR扩增Cytb、Cox Ⅰ和LDH基因的产物长度分别为735、1 323和355 bp.curtisi和wallikeri两个亚种在Cytb、Cox Ⅰ和LDH基因分别发现10、13、13个单核苷酸二态性位点,且大多数的二态性位点属于同义突变.此外,两个亚种内部也存在核苷酸多态性,同时发现1例血样的Cox Ⅰ基因存在693个碱基的缺失. 结论 对卵形疟患者血样的Cytb、Cox Ⅰ和LDH基因进行了单核苷酸多态性分析,丰富了卵形疟原虫基因多态性信息.
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